学科以提高中医药防治病原生物感染性疾病的临床疗效为核心，以发展病原生物学基本理论为目标，瞄准病原生物感染的中医药防治疗效、物质基础、作用机制、新药开发的主题，开展科学研究与学科建设。经过长期的建设和积累，学科形成了以“病原生物感染中医药防治”为核心的四大研究方向。方向一：流感病毒感染中医药防治研究；方向二：轮状病毒感染中医药防治研究；方向三：胃肠道微生态失调中医药防治研究；方向四：日本血吸虫感染中医药防治研究，四个方向研究居国内同类研究领域的领先水平。

目前学科共有教师16人，其中教授5人、副教授4人、博士生导师3人、硕士生导师4人，是一支年龄、职称、学历结构合理、团结奋斗的学科队伍。近5年学科主持国家“十一五”支撑计划子课题1项、“863”子课题2项、国家自然科学基金5项、教育部博士点基金2项、湖南省科技厅重点项目1项、湖南省科技厅一般项目3项、湖南省自然科学基金6项、厅局级课题20项。学科承担全校20多个本科专业或硕士研究生专业的教学任务，包括《病原生物学》、《医学免疫学》、《微生物学》、《医学微生物学》、《环境微生物学》、《寄生虫学》等课程。

学科建设的总体目标是：通过学科内涵建设，提高中医药学的学术水平，控制与减少感染性疾病对人类健康的危害，提高学科的社会服务能力，并使团队“产、学、研”协调发展，并将学科建成在国内有较高学术权威的优秀学术团队。